VENUE CENSUS
2024–2026
固定期刊全查
Nature、Science、Cell，以及八本固定的高选择性专业刊。只看原创研究，不设引用门槛。
174 篇A RESEARCHER'S LITERATURE ATLAS · CUT OFF 2026.08.04
计算结构生物学的前沿，长什么样？
不是扩散模型榜单，而是一份可以反查遗漏的研究名录。199 篇工作按科学问题聚类，神经网络、物理模拟、搜索、优化和实验约束只是方法标签。
- 199
- 篇最终纳入
- 174
- 篇近三年期刊论文
- 24
- 篇历史关键工作
- 8
- 个科学问题簇
01 · THE ADMISSION RULE
先固定入口，
再决定一篇论文重不重要
三个入口取并集。期刊入口追求逐期覆盖；引用入口捕捉预印本、会议和 AI 论文；历史入口只保留缺了就无法解释当前路线的转折点。
2024–2026
YEAR-ADJUSTED IMPACT
任何期刊、会议
或预印本
2024 年 >1000 引，2025 年 >300 引，2026 年 >50 引。引用数按工作去重，而不是把预印本与正式版相加。
1 篇HISTORICAL LANDMARK
不限年份
只问是否改变路线
PDB、分子动力学、共进化、AlphaFold、RFdiffusion 等作为今天各问题簇的来路。
24 篇
共同边界
三维结构、构象集合、分子相互作用或结构条件设计是核心对象
计算预测、模拟、设计、评测或计算结构解析是核心贡献
明确排除
纯序列功能预测纯实验结构计算仅作辅助综述与 Research BriefingNature Communications / Science Advances / PNAS 的期刊直入
02 · THE SHAPE OF THE FIELD
按问题聚类，
方法只是第二层
一个扩散模型可能属于设计、对接或构象采样。把“扩散”当一级目录，会把真正相邻的问题拆散，也会把传统模拟和评测工作漏掉。
03 · THE PAPER ATLAS
199 篇论文，
回答同样五个问题
不做长篇综述。卡片先用跨领域摘要讲清研究对象和必要术语；详情再交代研究问题、此前基础、真正难点、方法和实际创新。
1问题2基础3难点4方法5创新
论文浏览方式
卡片发现方向，列表核查覆盖
显示全部 199 篇
没有同时满足这些条件的论文。
清除一项筛选，或者直接搜索 DOI。
04 · COVERAGE AUDIT
它不是“我挑了这些”，
而是“我查过哪些”
页面保留检索漏斗、期刊逐年覆盖、排除边界和证据层级。你可以判断一篇已知论文是真遗漏，还是不满足这轮规则。
24,433固定期刊元数据记录
775高召回关键词候选
267首轮两次语义复核
456未召回标题负向审计
199最终工作级条目
READING DEPTH
正文能读则读正文，不能读就明确降级
五问由本地 Qwen3.6 27B Q4 生成初稿。准入由题录、摘要与全文分层复核；页面不把出版者简介或元数据包装成全文证据。
固定期刊覆盖表
数字是最终纳入的原创计算结构研究，不是期刊总发文量。
| 期刊 | 2024 | 2025 | 2026 | 合计 |
|---|
一项工作只出现一次
预印本、会议版和期刊版按 DOI 与标题归并。引用门槛针对工作级记录，避免重复累计。
年份门槛是动态快照
本轮检索日为 2026 年 8 月 4 日。OpenAlex 日额度触顶时用 Crossref 做候选发现与计数，并保留来源字段；未来复查可能改变边界条目。
完整性只对固定规则负责
期刊入口做逐期元数据普查，但主题判断仍可能有边缘案例。高引用入口受索引覆盖和引用合并影响；历史关键工作是解释路线的最小锚点，不是历史全书。
查看固定期刊名单与不直入的小子刊
直入普查：Nature、Science、Cell、Nature Methods、Nature Biotechnology、Nature Machine Intelligence、Nature Computational Science、Nature Structural & Molecular Biology、Nature Chemical Biology、Molecular Cell、Cell Systems。
不按期刊直入：Nature Communications、Science Advances、PNAS、Scientific Reports 与 npj 系列。它们仍可通过逐年引用门槛或历史关键工作入口。